Врожденный и приобретенный иммунитет в отношении инфекций направлены на то, чтобы максимально быстро распознать чужеродный агент и защитить организм путем его инактивации, а также обучения других клеток иммунной системы распознавать и уничтожать его.
В данном разделе мы рассматриваем комплекс генов, находящихся на первой линии защиты организма от инфекции. Они ассоциированы с ранним распознаванием чужеродных патогенов и обеспечивают обнаружение большинства видов бактерий и вирусов. Это, в свою очередь, влияет на скорость активации клеточного ответа, на предотвращение заболевания, на тяжесть и длительность его протекания.

Важные механизмы противовирусной защиты – препятствие проникновению вируса в клетку и его обнаружение вируса, запускающее сигнальные каскадов и активирующее иммунный ответ.
В данном разделе мы выделили гены, которые отвечают за распознавание ДНК, генерируемых при репликации ряда вирусов, и специфическую двухцепочечную РНК, характерную для них. Своевременное распознавание запускают противовоспалительные процессы и провоцируют увеличение продукции интерферонов типа I – таким образом, данные гены отвечают за сопротивляемость организма вирусным инфекциям

Вирус иммунодефицита человека - один из самых опасных вирусов, поскольку вызванная им ВИЧ-инфекция поражает всю иммунную систему человека. Из-за длительной латентной стадии развития заболевания ВИЧ остается одной из самых серьезных проблем в XXI веке.
Норовирус (одна из разновидностей энтеровируса) является возбудителем острой кишечной инфекции в 90% зарегистрированных случаев. Инфекции норовирусной этиологии отличаются высокой контагиозностью и поражают все возрастные группы.
Грипп - одно из самых распространенных инфекционных заболеваний, способное вызвать осложнения со стороны различных систем организма - от легочных (бронхит, пневмония) до заболеваний нервной системы (менингит, энцефалит)
Бактерия Helicobacter pylori - широко распространена как возбудитель желудочных инфекций. Ее активное размножении являются провоцирующим фактором для нарушения кислотности желудочного сока и развитию воспаления слизистых оболочек ЖКТ, что, в свою очередь, ассоциировано с высоким риском развития более тяжелых состояний (гастрит, язвенная болезнь, повышенный риск онкозаболеваний).
SARS (тяжелый острый респираторный синдром) является вирусным респираторным заболеванием, вызываемым коронавирусами (SARS-CoV и CoV-2, MERS). В данном разделе мы рассматриваем гены, ассоциированные с общей способностью организма распознавать патоген, а также гены формирования специфических механизмов противоинфекционного иммунитета